Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
USP18Q9UMW8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
USP18Q9UMW8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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