Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNMA8BQ9ULN7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms