Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJK0

TSR3, Ribosome biogenesis protein TSR3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR3Q9UJK0 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSR3Q9UJK0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSR3Q9UJK0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms