Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SLCO3A1Q9UIG8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms