Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HMGXB4Q9UGU5 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms