Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNAL1Q9UBT7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms