Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
POLKQ9UBT6 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms