Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
XCL2Q9UBD3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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