Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UFSP2Q9NUQ7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms