Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LMBRD1Q9NUN5 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMBRD1Q9NUN5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms