Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TREX1Q9NSU2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TREX1Q9NSU2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms