Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CENPMQ9NSP4 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms