Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
STRN4Q9NRL3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms