Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
DUOX2Q9NRD8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DUOX2Q9NRD8 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms