Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TMEM27Q9HBJ8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms