Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2W2

MIXL1, Homeobox protein MIXL1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIXL1Q9H2W2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MIXL1Q9H2W2 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms