Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RASSF4Q9H2L5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms