Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
POLR1EQ9GZS1 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
POLR1EQ9GZS1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms