Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ASXL3Q9C0F0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms