Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CIPCQ9C0C6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms