Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ROPN1BQ9BZX4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ROPN1BQ9BZX4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms