Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5DQ9BY66 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms