Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CARD11Q9BXL7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CARD11Q9BXL7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms