Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RAB11FIP5Q9BXF6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms