Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RIOK2Q9BVS4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RIOK2Q9BVS4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms