Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FYCO1Q9BQS8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FYCO1Q9BQS8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms