Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNN2Q99439 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CNN2Q99439 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms