Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PHF12Q96QT6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms