Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
TSNARE1Q96NA8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms