Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CMTM3Q96MX0 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms