Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COG8Q96MW5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COG8Q96MW5 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms