Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
C9orf85Q96MD7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms