Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUCLG2Q96I99 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms