Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LRRC39Q96DD0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC39Q96DD0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms