Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF183Q96D59 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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RNF183Q96D59 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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