Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UTP4Q969X6 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms