Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2E3Q969T4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms