Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
NEIL2Q969S2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NEIL2Q969S2 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms