Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAD50Q92878 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms