Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PHF3Q92576 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PHF3Q92576 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms