Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
UBXN4Q92575 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms