Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RGP1Q92546 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms