Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PALLDQ8WX93 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PALLDQ8WX93 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms