Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BEST4Q8NFU0 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BEST4Q8NFU0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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