Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACBD4Q8NC06 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ACBD4Q8NC06 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms