Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SAMD12Q8N8I0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SAMD12Q8N8I0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms