Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6C5

IGSF1, Immunoglobulin superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF1Q8N6C5 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGSF1Q8N6C5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms