Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPAP2Q8IXW5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms