Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LMNTD2Q8IXW0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LMNTD2Q8IXW0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms