Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KCNMB4Q86W47 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
KCNMB4Q86W47 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms